Structura organizatorică a Societății pe Acțiuni "Moldtelecom" este alcătuită din următoarele subdiviziuni:
 
Direcția dezvoltare rețele avansate și inovații
Colegii din această echipă sunt cei care elaborează și realizează planul strategic de dezvoltare a Moldtelecom în ceea ce privește tipurile de rețele de comunicații pentru serviciile  de acces la internet în bandă largă, televiziune și telefonie mobilă., modernizarea mijloacelor de comunicații electronice existente în conformitate cu obiectivele companiei și tendințele pieții.
 
Direcția operare și mentenanță 
Este abilitată să realizeze strategia S.A.”Moldtelecom” ce ține de întreținerea și exploatarea tehnică a mijloacelor de comunicații electronice  aflate în dotarea și gestiunea Companiei și monitorizarea, în regim non-stop, a reţelelor şi echipamentelor de telecomunicaţii din gestiunea companiei în scopul depistării oportune a deficienţelor de funcţionare; localizarea şi remedierea operativă a problemelor prin intervenţie la distanţă; escaladarea problemelor ce necesită intervenţii în teren către personalul operativ din teritoriu, serviciile exploatare a reţelelor sau, după caz, către specialiştii nivelului doi. Exercitarea controlului asupra remedierii incidentelor în termenele de control stabilite, în scopul respectării normelor interne sau stabilite de Regulator privind calitatea serviciilor prestate de către Companie utilizatorului final.
 
Departamentul Tehnologii informaționale
Este responsabil de elaborarea și implementarea strategiei de dezvoltarea şi modernizarea continuă a tehnologiilor şi produselor IT, elaborarea și implementarea softului aplicativ și funcționalităților noi, administrarea și mentenanța sistemelor și echipamentelor care se afla în gestiunea departamentului de tehnologii informaționale.
 
Direcția Achiziții și Gospodării
Este subdiviziunea care asigură completarea și aprovizionarea tehnico-materială completă și la timp a tuturor subdiviziunilor structurale ale companiei, a antreprenorilor și dealerilor, este responsabil și de:
•    asigurarea structurilor companiei cu transport auto, tehnică specială;
•    funcționarea fiabilă a obiectelor civile și a rețelelor inginerești;
•    organizarea lucrărilor de construcție și reconstrucție a obiectelor de telecomunicații și civile;
•    gestionarea Centrului de Instruire și agrement Ivancea;
•    organizarea alimentației publice;
•    realizarea planurilor strategice de dezvoltare a rețelelor de comunicații electronice ale companiei în baza tehnologiilor prin fir și radioacces.
 
Departamentul Comercial
Include în sine echipa de Vânzări, Marketing, Customer Care și  exploatare și instălări a rețelelor de telecomunicații electronice. Are întotdeauna ca obiectiv primordial realizarea planului de vânzări pentru produse și serviciile oferite de Moldtelecom, dezvoltarea produselor noi și deservirea impecabilă a abonaților companiei. Activitatea lor este una foarte activă și dinamică întrucât acestea echipe au grija de organizarea și desfășurarea proceselor de deservire a clienților pe întreg teritoriul țării.
Mai mult, ei sunt implicați în promovarea directă a serviciilor companiei prin activități de door to door.
 
Direcția Customer Care
Echipa Customer care face parte de departamentul Comercial și este cea care interacționează cu clienții și are în gestiune oferirea suportului informațional clienților companiei. Ei sunt cei care:
•    au grijă de oferirea suportului în activarea serviciilor și gestionarea conturilor;
•    implementează politica de retenție a clienților;
•    asigură prevenirea și diminuarea sumelor debitoare pentru serviciile prestate abonaților companiei;
•    contribuie la diminuarea intenției de reziliere a contractelor;
•    examinează și prelucrează reclamațiile;
•    gestionează procesele de prevenire și diminuare a sumelor debitoare pentru serviciile prestate;
•    oferă suport companiilor de colectare a creanțelor.

Direcția Marketing
Echipa de marketing face parte de departamentul Comercial și  este cea care ține pulsul pe tendințe și indică direcția de dezvoltare a companiei. Aici se creează strategia de dezvoltare a companiei, strategia și planul de marketing. Tot colegii de la marketing:
•    creează oferte promoționale;
•    realizează cercetări de marketing în vederea analizei tendințelor pieței și comportamentului consumatorului;
•    creează campanii de promovare pentru ofertele nou lansate și pentru întreaga gama de servicii oferite;
•    dezvoltă proiecte și campanii de PR în vederea promovării serviciilor si imaginii companiei;
•    dezvoltă proiecte interne orientate spre menținerea și sporirea fidelității angajaților;
•    creează politici de fidelizare și retenție a clienților existenți.
 
Departamentul HR 
Echipa HR (Human Resource)   planifică, dezvoltă și administrează activitățile și programele destinate utilizării cât mai eficiente a resurselor umane ale companiei, și 
 
Direcția juridica și reglementări
Asigură buna desfășurare sigură din punct de vedere juridic a companiei, anticipând și rezolvând problemele legate de aplicarea normelor și reglementărilor legale în activitățile comerciale.
 
Departamentul Finanțe
Este responsabil de gestionarea cu succes a conturilor contabile, ținerea strictă a evidenței activelor și pasivelor companiei, conformarea rigorilor fiscale, etc.
•    Organizează și desfășoară activitatea financiar-contabilă a companiei în conformitate cu dispozițiile legilor, care sunt în vigoare în Republicii Moldova.
•    Urmărește evoluția indicatorilor financiari, precum și respectarea disciplinei de plan și a celei financiare de către companie.
•    Asigură întocmirea documentelor de planificare financiară, care să urmărească utilizarea eficientă a resurselor de capital puse la dispoziție.
•    Asigură plata integrală și la timp a remunerațiilor personalului.
•    Raportează lunar situația privind execuția bugetului de venituri și cheltuieli.
•    Răspunde de prezentarea la termen a situațiilor financiare trimestriale și anuale, și a altor rapoarte importate, cum ar fi toate declarațiile fiscale.
•    Asigură îndeplinirea sarcinilor contabilității cu privire la exercitarea controlului financiar atât cel preventiv, cât și a celui ierarhic operativ-curent.
 
Direcția Securitate
Această direcție are funcția de administrare a riscurilor și control intern în cadrul companiei.
 
Direcția Audit Intern
Are rolul de a evalua si a asigura eficienta, eficacitatea si conformitatea cu normele si politicile companiei, evaluarea proceselor si procedurilor din cadrul companiei pentru a se asigura ca sunt eficiente, eficace si conforme cu politicile companiei si cu reglementările aplicabile.